先后与英国、日本、美国等31个国家的64所院校建立了交流合作关系。2012年获准设立中国-东盟教育培训中心，2014年获准成为中国政府奖学金接收外国留学生院校。与英国胡弗汉顿大学、新西兰林肯大学、韩国尚志大学共同开展中外合作办学项目。与越南太原农林大学、泰国曼松德·昭帕亚皇家师范大学合作举办本科生2+1+1联合培养项目。与美国加州大学伯克利分校、美国加州大学戴维斯分校、日本鹿儿岛大学等11所国外高校开展学生交流。
长期承办科技部、农业农村部等部委和中国—东盟合作基金、亚洲专项基金等国际组织委托的援外农业科技国际培训。先后主持联合国全球环境基金、欧盟、亚洲开发银行和国际水稻研究所等资助的国际合作科研项目20余项。
新时代新征程，学校将立足云南、面向全国、辐射南亚东南亚，聚焦区域及资源优势，主动对接国家战略和区域发展重大需求，扎根祖国西南边疆建设特色鲜明的高水平农业大学，把学校建设成为农业高层次人才培养高地、科技创新园地、乡村振兴基地，在云岭大地上谱写更加壮美的华章。
